2003-08-17

アミノ酸の略号

アミノ酸の一文字略号と三文字略号

一文字 三文字 名称
A Ala Alanine アラニン
B Asx アスパラギン酸またはアスパラギン (1)
C Cys Cysteine システイン
D Asp Aspartic acid アスパラギン酸
E Glu Glutamic acid グルタミン酸
F Phe Phenylalanine フェニルアラニン
G Gly Glycine グリシン
H His Histidine ヒスチジン
I Ile Isoleucine イソロイシン
K Lys Lysine リシン
L Leu Leucine ロイシン
M Met Methionine メチオニン
N Asn Asparagine アスパラギン (2)
P Pro Proline プロリン
Q Gln Glutamine グルタミン (2)
R Arg Arginine アルギニン
S Ser Serine セリン
T Thr Threonine トレオニン
U Sec Selenocysteine セレノシステイン (3)
V Val Valine バリン
W Trp Tryptophan トリプトファン
X Xaa 未知またはその他のアミノ酸 (4)
Y Tyr Tyrosine チロシン
Z Glx グルタミン酸またはグルタミン (5)
  1. Asx は Asp または Asn を示す。同様に、B は D または N を示す。
  2. CAS では Asn, Gln の代わりに、Asp(NH2), Glu(NH2) を用いて示す。
  3. Sec (U) は IUPAC-IUBMB Newsletter 1999 に記載されている。
  4. Unspecified amino acids (unknown or other).
  5. Glx (Z) は Glu, Gln のほか、Gla (4-カルボキシグルタミン) や Glp (5-オキソプロリン) などをも示す。

非標準アミノ酸の三文字略号

三文字 名称
Aad [3AA,SymAA] 2-Aminoadipic acid 2-アミノアジピン酸
βAad [3AA,SymAA] 3-Aminoadipic acid 3-アミノアジピン酸
Abu [3AA,SymAA] 2-Aminobutanoic acid 2-アミノブタン酸
A2bu [3AA,SymAA] 2,4-Diaminobutanoic acid 2,4-ジアミノブタン酸 (cf. Dbu)
Ahx [3AA] 2-Aminohexanoic acid 2-アミノヘキサン酸 (cf. Nle)
εAhx [3AA,SymAA] 6-aminohexanoic acid 6-アミノヘキサン酸
βAla [3AA,SymAA] β-Alanine β-アラニン
Ape [3AA] 2-Aminopentanoic acid 2-アミノペンタン酸 (cf. Nva)
A2pr [3AA,SymAA] 2,3-Diaminopropanoic acid 2,3-ジアミノプロパン酸 (cf. Dpr)
Apm [3AA,SymAA] 2-Aminopimelic acid 2-アミノピメリン酸
A2pm [3AA,SymAA] 2,6-Diaminopimelic acid 2,6-ジアミノピメリン酸 (cf. Dpm)
Cit [3AA] Citrulline シトルリン
Cya [3AA] Cysteic acid システイン酸
Dbu [3AA] 2,4-Diaminobutanoic acid 2,4-ジアミノブタン酸 (cf. A2bu)
Dpm [3AA] 2,6-Diaminopimelic acid 2,6-ジアミノピメリン酸 (cf. A2pm)
Dpr [3AA] 2,3-Diaminopropanoic acid 2,3-ジアミノプロパン酸 (cf. A2pr)
Gla [3AA] 4-Carboxyglutamic acid 4-カルボキシグルタミン酸
Glp [3AA] 5-Oxoproline 5-オキソプロリン(Pyroglutamic acid ピログルタミン酸)
<Glu [3AA,SymAA] 5-Oxoproline 5-オキソプロリン(Pyroglutamic acid ピログルタミン酸) (cf. Glp)
Hcy [3AA,SymAA] Homocysteine ホモシステイン
Hse [3AA,SymAA] Homoserine ホモセリン
Hse> [3AA,SymAA] Homoserine lactone ホモセリンラクトン (cf. Hsl)
Hsl [3AA] Homoserine lactone ホモセリンラクトン
5Hyl [SymAA] 5-Hydroxylysine 5-ヒドロキシリシン (Hyl)
aHyl [3AA,SymAA] Allohydroxylysine アロヒドロキシリシン (5-位)
3Hyp [3AA,SymAA] 3-Hydroxyproline 3-ヒドロキシプロリン
4Hyp [3AA,SymAA] 4-Hydroxyproline 4-ヒドロキシプロリン (Hyp)
aIle [3AA,SymAA] Alloisoleucine アロイソロイシン
Nle [SymAA] Norleucine ノルロイシン (cf. Ahx)
Nva [SymAA] Norvaline ノルバリン (cf. Ape)
Orn [3AA,SymAA] Ornithine オルニチン
Sar [3AA,SymAA] Sarcosine サルコシン
aThr [3AA] Allothreonine アロトレオニン
Thx [3AA] Thyroxine チロキシン

参考文献

  1. [3AA] IUPAC-IUB JCBN. Nomenclature and Symbolism for Amino Acids and Peptides (Recommendations 1983). Pure Appl. Chem. 56, 595-624 (1984).
  2. [SymAA] IUPAC-IUB JCBN, Symbols for Amino-Acid Derivatives and Peptides (Rules Approved 1974). Pure Appl. Chem. 40, 315-331 (1975).
  3. A One-Letter Notation for Amino Acid Sequences (Definitive Rules 1971). Pure Appl. Chem. 31, 639-645 (1972).
  4. IUPAC-IUBMB Newsletter 1999
    cf. url: http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/newsletter/1999/item3.html
  5. [CAS] CAS. Chemical Abstracts, Index Guide, 1992. Appendix IV, ¶205.

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